بلغ ذروته بما تركه لنا من موسوعته الرجالية التي أسماها : ( معجم رجال الحديث وتفصيل طبقات الرواة ) ، ويقال : إنّ تأليف هذه الموسوعة كان بمساعدة عدد من تلاميذه ، مع أنّه لم يُشر لهذا في الموسوعة نفسها . وقفة مع موسوعة ( معجم رجال الحديث ) يمكن التعرّف على هذه الموسوعة القيّمة التي تركها لنا الإمام الخوئي في أربعة وعشرين مجلّداً ، من خلال مجموعة نقاط : 1 - تصدّرت الموسوعة مجموعة من المقدّمات التصوّرية والتصديقيّة حول علم الجرح والتعديل ، وأهم قواعد تقويم رواة الحديث ، بيّن فيها رأيه حولها قبولًا ورفضاً ، كما ناقش دعوى صحّة كلّ ما في الكتب الحديثية الأربعة ، وفيها ردّ على المقولة المشهورة لأستاذه الشيخ محمد حسين النائيني ( 1355 ه - ) ، والتي ترى « أنّ المناقشة في أسانيد الكافي حرفة العاجز » « 1 » ، ثم ختم الخوئي المقدّمة بنظرة حول أبرز الكتب الرجاليّة وتقويمه لها . وتبيّن لنا هذه المقدّمة المنهج الرجالي والقواعد السندية والرجاليّة التي يعتمدها السيد الخوئي ، لكنّها تبدو مختصرةً جداً لا تزيد عن عشرات الصفحات ، فيما قضايا كلّيات علم الرجال باتت تتحمّل في هذه المرحلة حجماً أكبر من البحث والنقد والتفنيد والتأمّل ، ولعلّ السيد الخوئي كان متعمّداً للاختصار فيها ؛ ليقدّم مجرّد تصوّر عام عن نظريّاته ، لا سيما وأنّنا وجدناه ترك بعض النظريات الرجاليّة وبعض الأبحاث التي لطالما وجدناها تُذكر في الفوائد الرجاليّة عند علماء هذه المرحلة ، وهي أبحاث يمكن أن نجد رأي السيّد الخوئي

--> ( 1 ) الخوئي ، معجم رجال الحديث وتفصيل طبقات الرواة 1 : 81 .